A finalidade do Conselho Gestor é discutir, identificar, acompanhar, avaliar, deliberar e fiscalizar a execução das ações do CEREST MACROSUL, nos limites da sua competência, de acordo com as diretrizes políticas definidas pela Comissão Intersetorial de Saúde do Trabalhador, do Conselho Estadual de Saúde (CIST/RS) e aprovadas pelo Conselho Estadual de Saúde.

O Conselho Gestor é constituído por 20 entidades e órgãos os quais tenham relações com a Saúde do Trabalhador, sendo dez representações de usuários, equivalente a 50%, cinco representantes dos trabalhadores da saúde, equivalente a 25%, e cinco representantes dos Gestores em Saúde e Prestadores de Serviços ao SUS, equivalente a 25% os quais completam os 100%.

O Conselho Gestor deste Centro foi instituído no dia 30/04/2003, o qual se reúne na última sexta-feira de cada mês, no turno da manhã, na sede do CEREST MACROSUL.